数据库的基本常识

GeneCards数据库的最基本常识讲起，让初识GeneCards、一脸懵逼的“0基础”学员们快速进阶入门。

老实说，当我第一次接触 GeneCards 时，我完全不知所措。
界面中有太多东西，感觉更像是一个小型图书馆而不是数据库。
但我一咬牙，一看，发现还真有事。
我们来谈谈基因和表型之间的关系。
我了解到基因突变与某种罕见疾病直接相关。
文献被大量引用，比阅读医学期刊更全面。
老实说，这个集成平台的伟大之处在于它可以将不同的信息整合在一起，这与您漫无目的地搜索 NCBI 并最终得到一堆不相关的文档不同。

我认为新手需要先了解基本界面才能上手。
比如顶部的搜索栏就是核心。
输入基因名称将直接发生，这比直接从 URL 访问要快得多。
还有一个“概览”，以简单、直白的方式为您提供有关基因的基本信息和一些有助于快速定位的关键链接。
坦白说，这样的设计非常适合急于进行初步搜查的医生。

有趣的是，基因卡部分的设计就像拼图一样。
给我印象最深的是“Interactions”和“Pathways”，它们可以让你直接看到基因和其他蛋白质之间的相互作用网络，以及它所涉及的信号通路。
例如，我测试了EGFR基因，它清楚地显示了哪种蛋白质可以与其结合以及通过哪种途径影响细胞增殖。
这种类型的可视化非常直观，比仅仅查看文献表格要好得多。

但是有一个小坑：部分版块的数据没有及时更新。
比如我曾经查过某个基因的临床意义，发现它引用了几年前写的文献。
后来，我转向 PubMed 了解最新进展。
因此，使用时要小心，不要将旧信息误认为是新信息。
我记得2 01 8 年左右数据有大幅更新，但是说到细节具体基因，你可能要自己测试一下。

在谈论课程时，我认为重点应该放在最常用的部分。
例如，“功能”和“疾病”与基因研究的基本问题直接相关。
还有变异，可以让您测试基因突变与疾病风险之间的关系。
临床医生特别喜欢阅读它。
平心而论，8 个关键部分都已经讲解得很详细了，基本涵盖了日常需求。
像“蛋白质”或“出版物”这样的次要内容也很有用，但当你真正需要它们时，你可以忽略它们。

后来我发现了一个有效使用过滤条件的技巧。
例如，在检查疾病关联时，您可以按疾病类型、严重程度甚至地理分布进行筛选，并查明关键信息。
我花了很长时间才掌握这一点。
这确实是一个隐藏的功能。

最后，老实说，像 GeneCards 这样的平台的价值在于它的“一站式服务”，它省去了您在不同数据库之间切换的麻烦。
但如果你用得好，你也可以挖掘出很多别人错过的信息。
例如，我曾经在寻找一个冷门基因，并在GeneCards中找到了一些与之相关的临床试验数据。
单独搜索会非常耗费人力。

这个训练营听起来很有趣，尤其是训练形式。
说到科学研究，坚持下去是非常困难的。
与其自己坚持，不如有外部压力。
限时免费报名听起来是件好事，但一定要检查清楚时间，报名后记得把加班费微信发给老师，不然你的努力就白费了。
如果你加入一个团体，你实际上就可以交流，但这也取决于团体的质量。
有些小组只是聊天，这是浪费时间。

Oracle数据库的一些基本常识

2 02 3 年，朋友问我一些Oracle数据库的基础知识，我给他解释了。
Oracle数据库组件包括：数据库进程和缓冲区（实例）、SYSTEM表空间、其他DBA定义的表空间、在线恢复日志、归档恢复日志（可选）和其他文件。

对于“日志”，Oracle数据库使用数据库备份、日志、undo段和控制文件来保护数据。
每个 Oracle 数据库实例都提供一个日志，记录对数据库所做的所有更改。
在线日志与 LGWR 进程配合，立即记录对实例所做的所有更改。
归档日志用于数据库备份和恢复。

从物理和逻辑存储结构来看，Oracle RDBMS由表空间组成，表空间由数据文件组成。
数据文件以内部块为单位进行格式化，块大小由数据库管理员在创建时定义，范围从 5 1 2 到 8 1 9 2 字节。
对象的长度可以用初始长度、下一个长度、最小长度和最大长度来指定。

至于Oracle和Microsoft SQL Server之间网络协议的比较，我不太清楚这部分。
你可以拿定主意。