GeneCard获取疾病基因(一)

直接结论: 1 .访问GeneCards官方网站:https://www.genecards.org/ 2 . 搜索“胰腺癌” 3 .查看目标列表,选择得分高于中位数的目标 4 . 点击“导出”即可下载Excel格式的数据 5 .使用Excel分析目标分数、函数、表达式等。
6 . 结合其他数据库验证目标 7 、注意疾病名称准确,保护隐私,避免数据误解。

请列举常见的核酸数据库有哪些

GenBank:由INSDC核心成员NCBI维护的全球DNA序列数据。
EMBL 银行(ENA):EBI 管理、欧洲核酸数据库、INSDC 欧洲节点。
DDBJ:NIG维护,亚洲序列收集,INSDC亚洲代表。
RefSeq:参考序列数据库,人工审核+自动集成,由NCBI开发。
dbEST:支持GenBank分支、EST序列存储、基因表达分析。

每天交换数据,确保信息同步。
RefSeq 比 GenBank 更复杂、更可靠。
dbEST 专注于 EST 来快速发现基因表达。

自己掂量一下。

史上最全的30个LncRNA数据库,打包一次全带走!

TANRIC:癌症非编码RNA数据库,整合TCGA数据并分析lncRNA表达变异。
LNCediting:RNA编辑预测lncRNA功能并分析不同物种的序列数据。
Starbase:lncRNA、miRNA 和 ceRNA 相互作用网络和大规模 CLIP-Seq 数据构建。

LncRBase:人和小鼠lncRNA转录本、基本特性、基因组位置等
lncipedia:人类lncRNA详细信息、序列、转录、同源性等
LncRNASNP:人/鼠lncRNA单核苷酸多态性和SNP信息融合。

lnCAR:癌症样本数据、ChIP 表达分析和临床数据。

LncRNome:人类lncRNA、基因间非编码RNA等的全面解释。

CancerLncRNACensus:与癌症相关的lncRNA基因,提供高可信度数据集。

lncLocator:lncRNA亚细胞定位预测,深度学习技术。

LncRMap:整合 lncRNA 表达谱并提供有关 miRNA 调节因子的信息。
oncolnc:TCGA数据、人类lncRNA表达、Cox回归分析等。

ChIPBase:长非编码RNA表达图谱和转录调控解释。

LncBook:有关lncRNA的综合信息,包括ID、功能、疾病关联等。

Lnc2 Meth:lncRNA上的DNA甲基化位点、疾病和转录搜索模式。

LncRNADiseasev2 .0:lncRNA疾病关联信息,高可信度数据库。

lncACTdb:用于研究监管关系的 ceRNA 综合信息。

NONCODE:注释疾病相关的 lncRNA 并支持 BLAST 系统中的研究。

DIANAtools:基因组数据分析,miRNA、lncRNA 和蛋白质编码基因分析。

GTRD:lncRNA转录因子结合分析和调控网络构建。

Lnc2 Cancerv2 .0:cirRNA和lncRNA与疾病的关系,以及肿瘤多个亚型的信息。
Catrabide:预测蛋白质和 RNA 结合特性,支持大规模候选预测。

LnCeVar:整合文献和数据库中的高通量序列数据以支持高级搜索。

LncRNA2 Target:lncRNA靶点关系资源,支持高通量数据和GEO编号查询。
LongTarget:预测 DNA 结合基序和 lncRNA 结合位点。

LNCat:人类lncRNA定位资源,具有搜索、可视化和下载功能。

ExoBCD:乳腺癌外泌体、lncRNA、miR和mRNA相关分子的研究信息。

摘要:这3 0个数据库涵盖了lncRNA研究的多个方面,有利于深入探索。
你自己掂量一下吧。