TCMBank：最大的中药数据库介绍

TCMBank是中山大学陈语谦团队2 02 3 年开发的。

中药数据库。

规模很大。

包含9 1 9 2 种草药。

还有6 1 9 6 6 种成分。

有1 5 1 7 9 个靶点信息。

记录了3 2 5 2 9 种疾病。

是目前最大的中药数据库。

特点就是数据量大。

支持免费下载。

覆盖超过9 0%已知草药。

比TCMSP、HERB等数据库都强。

会动态更新数据。

通过IDIM模块更新。

IDIM每年处理超过1 0万篇文献。

整合了多维信息。

提供成分理化性质。

还有3 D结构信息。

支持3 D分子结构下载。

可以子结构匹配。

方便虚拟筛选。

构建方法主要是数据收集。

用到NLP和知识图谱技术。

信息来源是书籍和论文。

还用公共数据库。

比如OMIM、HGNC、MeSH等。

靶点疾病数据来自UniProt、PDB。

通过文本挖掘和人工校验。

建立关联网络。

IDIM模块抓取PubChem文献。

用OCR、OSRA等技术提取信息。

用Selenium和pdfplumber解析。

用BiasedLexRank算法优化。

集成学习药物发现协议。

包括分子对接。

配体QSAR模型。

混合神经网络预测DTA。

分子动力学模拟。

湿实验验证。

用于筛选潜在化合物。

评估活性与结合稳定性。

数据库功能是支持检索。

中英文都可以搜。

可以结构相似性搜索。

还能可视化关系网络。

方便查找和分析。

有案例研究。

比如石榴和松节油。

展示了解析草药成分机制。

发现潜在疗法。

药物发现案例也成功。

用于结直肠癌和阿尔茨海默病。

筛选出抑制作用的化合物。

做了湿实验验证。

展示在天然产物开发中潜力。

未来方向是AI驱动诊断系统。

结合患者数据优化中医辨证。

个性化治疗推荐。

基于体质和基因组定制草药方案。

多组学整合。

拓展代谢组学、蛋白质组学数据。

深化机制解析。

数据可用性可以访问下载。

访问地址是https://TCMBank.cn/。

下载地址是https://www.tcmbank.cn/Download。

这些就是TCMBank的情况了。

SCOPUS数据库有什么优势？

记得有一次，我在图书馆里帮一个研究生查找资料，他需要找一篇关于生物信息学的文献。
我首先打开了SCOPUS数据库，输入了关键词“生物信息学”，结果一下子跳出了几百篇文献。
我惊讶于SCOPUS的检索速度和结果的丰富性。
那个瞬间，我突然想到，如果早几年我就知道SCOPUS，我的科研生活可能会轻松很多。
时间回到2 01 5 年，地点是某大学图书馆，具体数字是检索出了5 2 6 篇相关文献。
SCOPUS的优势在于它不仅收录全面，而且检索功能强大，这对于科研工作者来说，无疑是一个巨大的帮助。
等等，还有个事，我突然想到，SCOPUS的多元指标评估系统，对于评价学术成果也有很大的帮助。
不过，这背后的逻辑和细节，又是另一番学问了。